Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及磷酸化终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合多肽和双多肽 DNA 组成的特殊大分子构件，在真核生物和真核生物的基因序列组里常见于相当多且值得注意。R-loop 在很多关键的生物学更再进一步里发挥最主要动态，除此以外染色质粘贴、磷酸化磷酸化、DNA 损害修缮以及基因序列组比较稳定性等，但其如何被正确地磷酸化的选择性尚不确实。m6A 粘贴作为几天后 RNA 上稀土元素最高者的粘贴种类，相当多积极参与哺乳动物的退化、免疫、干细胞修正、脂肪同化、以及生成和转移等全人类更再进一步。然而，目前尚不确实 m6A 是否能作为 R -loop 里 RNA 溶质的便是特征来磷酸化 R -loop 高水平，进而发挥各种生物学动态。里科院北京基因序列溶质析所杨运桂、任捷与北大生科院孙前文他的团队合作分析，挖掘出 m6A 能比较稳定 R-loop 的形成，进而磷酸化基因序列磷酸化的有效暂时里止。这一重大突破以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞分析》（Cell Research）杂志。分析他的团队首先通过斑点分子杂交和免疫荧光新科技，挖掘出敲低 m6A 甲基转移酶 METTL3 显着减小 R -loop 高水平，且该磷酸化效用缺少 METTL3 甲基转移酶活性。随后，他的团队核心人物依靠高效基质色谱联合质谱法新科技，挖掘出相比较于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 溶质有更加掺入的 m6A 粘贴。再进一步依靠基于双多肽 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合多肽免疫共沉淀高通量DNA新科技（ssDRIP-seq），挖掘出下调的 R -loop 主要掺入在磷酸化暂时里止区域，R-loop 变化程度与 m6A 的半径和粘贴高水平具体。为了探索 m6A 对 R -loop 磷酸化的生物学动态，分析他的团队绘成了 RNA 磷酸化磷酸化启动子的高分辨率图说，并在 MYC、ACTIN 基因序列上进行多种磷酸化活性监测，挖掘出 m6A 倡导 R -loop 形成是磷酸化暂时里止阶段的关键步骤，可以防止 RNA 磷酸化的磷酸化通读。最后，他的团队核心人物构建了针对磷酸化通读的报告基因序列控制系统，通过 m6A 粘贴启动子的特异性再进一步证明 m6A 对于 R -loop 形成及磷酸化暂时里止的关键效用。该分析挖掘出了 m6A 特异性粘贴的共磷酸化磷酸化动态，揭示了 RNA 特异性粘贴对染色质构件的影响，以及 R-loop 构件里的 RNA 溶质被粘贴后对其自身稳态的磷酸化选择性，阐述了 m6A 通过比较稳定 R-loop 而倡导磷酸化正常暂时里止的现象，为再进一步分析 m6A 与 R-loop 的磷酸化选择性和适当生物学动态备有了基本的新科技和理论支架。该分析获取了里科院战略性先导科技专项、发达国家学科以及发达国家重点研发计划等基金捐助。早期来历：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).