Nat Commun:循环CD8+T细胞的染色质可及性预测胃癌患者对抗PD-1临床的应答

2022-01-10 00:15:09 来源:
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关于持续功能性抗病毒原刺激(如慢功能性病毒感染和)引起的免疫反应肝硬化和浸润淋巴细胞会(TIL)紊乱的分析辨识,细胞会较厚蛋白与免疫反应的机能受损有关。这些蛋白质包括多重共抑制遗传物质或检查点复合物,如CTLA-4(细胞会毒功能性T淋巴细胞会抗病毒原4,CD152),PD-1(比如说死亡复合物1,CD279),TIM-3(T细胞会免疫反应球蛋白粘蛋白-3)和LAG-3(淋巴细胞会重置基因3)。

因此,以外已开展采用针对免疫反应检查点(即免疫反应检查点抗病毒ICI)的里和抗病毒体(Abs)以稳定下来T细胞会机能的系统功能性临床试验。这些ICI口服以外已被批准运用于那些至少有两项系统功能性化学疗法失败的转移功能性胃癌(mGC)病变。

尽管遗传物质分析已比对出一小部分胃癌(GC)病变可从抗病毒PD-1病患里给与,但并不是所有反应都可以原则上通过高通量来解释。

以ATAC-seq辅以的水分子诊断左图

该分析通过系统性评估病变外周血里重复CD8+T细胞会的全遗传物质肌动蛋白可及功能性,旨在探究与抗病毒PD-1病患差异反应系统功能性的各部位遗传学环境因素。

通过ATAC-seq(联结较低通量高通量关键技术的靶向封闭肌动蛋白的分析新方法)关键技术,分析人员确定了肌动蛋白的截然不同封闭区域,该区域都能特别是在区分抗病毒PD-1病患的此番者和非此番者。在此番者组里,重复CD8+T细胞会肌动蛋白封闭度较较低的GC病变特别是在富集。相应地,在重复CD8+T细胞会的特定遗传物质位置上不具备较低肌动蛋白渐进的病变,其生存率要特别是在较低于肌动蛋白封闭功能性的病变。

重复CD8+T细胞会肌动蛋白封闭度与抗病毒PD-1病患此番的系统功能性功能性

综上,该分析揭示了弧CD8+T细胞会的各部位遗传学特征可运用于比对潜在的给与于抗病毒PD-1病患的转移功能性GC病变。

原始注解:

Shin, H.M., Kim, G., Kim, S. et al. Chromatin accessibility of circulating CD8+ T cells predicts treatment response to PD-1 blockade in patients with gastric cancer. Nat Commun 12, 975 (12 February 2021).

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