Lancet Oncol:肾透明蛋白质癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2022-01-03 00:11:20 来源:
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一.研究工作氛围

厌食症与膀胱薄膜蛋白乳癌 (ccRCC)的安全性提高有关,但厌食症又对立地与该的预后改善有关,其潜在机制尚不一致。现作者对厌食症病患者和较长时间锥体型病患者在原发和腺周碳水化合物第一组织中所的静脉转换成和致病核糖体第一组歧异展开研究工作深入研究工作。

本文介绍了DNA请注意达引起的微环境的歧异有助于解释厌食症病患者的适应环境优势(厌食症不确定性)。

二.深入研究工作程序三.文章概述1.COMPARZ缓冲区、TCGA-KIRC缓冲区、MSK致病外科手心法缓冲区数据资料获取、外科

在COMPARZ缓冲区的453名病患者中所,有375名(83%)病患者有着可用的微阵列数据资料,外科手心法前BMI测量以及无进展和总锥体适应环境数据资料展开深入研究工作(请注意1)。除119名(26%)超载病患者外,来自COMPARZ试制的再次缓冲区包括256名(68%)病患者(n=256)。

请注意1.COMPARZ病理试制缓冲区的人口总数统计学和病理构造

TCGA-KIRC缓冲区中所的332可有病患者中所,分析了经膀胱切除心法外科手心法的152可有(46%)中叶(即AJCC III和IV期)ccRCC病患者的病理和人口总数统计学数据资料(请注意2)。在毫无关系59名(39%)超载病患者后,仍要取得的缓冲区包括93名病患者(n=93)。

请注意2.中叶薄膜蛋白膀胱蛋白乳癌TCGA-KIRC缓冲区的人口总数学和病理构造

从62可有MSK一处碳水化合物第一组织缓冲区中所展开膀胱脏切除心法的非转移性薄膜蛋白RCC病患者中所取得了原发性和一处碳水化合物样品。在这个缓冲区中所,从59名病患者的PNN(膀胱周郊外)一处碳水化合物,25名病患者的PNA(远离膀胱周)一处碳水化合物以及55名病患者的第一组织中所取样。在毫无关系超载病患者之后,再次缓冲区包括41名(69%)PNN样品病患者, PNA样品为17(68%),样品为37(67%)。从最初的203名参与者的MSK致病外科手心法研究工作人群中所毫无关系74名(36%)超载病患者后,总适应环境深入研究工作的再次缓冲区包括129名(64%)参与者(请注意3)(n=129)。

请注意3. 有别于MSK致病外科手心法的病理试制缓冲区的人口总数统计学和病理构造

2.厌食症的膀胱薄膜蛋白乳癌病患者相对于较长时间锥体型的膀胱薄膜蛋白乳癌病患者总适应环境期较短

根据KM适应环境深入研究工作,在3第一组中所都辨认出厌食症病患者的总适应环境期较短。在TCGA-KIRC缓冲区中所,经分段测量仪器后,厌食症病患者的总锥体存活期少时较长时间锥体型第一组;在COMPARZ缓冲区中所,经IMDC安全性极低分测量仪器后,胖病患者的总锥体存活期也少时较长时间锥体型第一组。在MSK致病疗法缓冲区中所,经IMDC安全性极低分测量仪器后,BMI与死亡率的无显著歧异(如示意图1)。

示意图1.TCGA-KIRC缓冲区 (A)、COMPARZ 缓冲区(B)和MSK致病外科手心法缓冲区(C)的总适应环境期

3.COMPARZ缓冲区中所厌食症病患者有着好处的PFS

对CPMPARZ缓冲区KM深入研究工作后,KM直线辨识,COMPARZ缓冲区中所厌食症病患者更为长时间锥体型病患者有着好处的PFS。

示意图S1.COMPARZ缓冲区中所厌食症病患者更为长时间锥体型病患者有着好处的PFS

4.可用一线药物外科手心法,厌食症病患者仍有着好处的OS

KM直线辨识了在可用一线半胱氨酸丝氨酸衍生物(pazopanib或Sunitinib)的两个外科手心法第一组中所,厌食症病患者的OS仍然较较长时间锥体型病患者好。

示意图S2.COMPARZ缓冲区可用一线药物外科手心法第一组的总适应环境期深入研究工作

5.COMPARZ缓冲区中所,厌食症与较长时间锥体型的病患者核糖体第一组DNA构造实际上显著歧异

好好完上述深入研究工作,作者在三个缓冲区中所证实厌食症不确定性实际上之后,接下来在COMPARZ缓冲区中所对厌食症和较长时间锥体型病患者分析了核糖体第一组学歧异。先是好好了HallmarkDNA集的GSEA深入研究工作,更为厌食症病患者与较长时间锥体型病患者中所间的歧异:厌食症病患者中所辨识栓塞、TGF-β、上皮-间充质转变和静脉转换成信号路中显著升至,极低亮伤口愈合都能的激活(示意图A)。示意图B是对示意图A比对的几个DNA请注意达路中的Enrichment plots。

示意图S4.COMPARZ缓冲区中所厌食症病患者与较长时间锥体型病患者的ccRCC核糖体第一组DNA构造实际上显著歧异

6.COMPARZ缓冲区与TCGA-KIRC缓冲区 中所厌食症更为长时间锥体型病患者的静脉转换成极低分极低

在GESA衍生的构造DNA集静脉转换成极低分更为中所,厌食症病患者极低于较长时间锥体型病患者(如示意图2)。

示意图2.COMPARZ缓冲区(A)与TCGA-KIRC缓冲区 (B)中所厌食症原发病患者与较长时间锥体型病患者的静脉转换成的z score

7.较长时间锥体型与厌食症病患者的致病蛋白群无显著歧异

对较长时间锥体型(7可有)与厌食症(16可有)病患者的原发的主要致病蛋白数量均有别于流式蛋白心法展开分析。示意图A辨识了厌食症病患者与较长时间病患者中所间的致病蛋白群的总锥体歧异。示意图B一致辨识了厌食症和较长时间锥体型病患者T蛋白群的伴生水平。辨认出较长时间锥体型与厌食症病患者的致病蛋白群无引人注意歧异,致病蛋白伴生的某种程度与BMI毫无关系。

示意图S9.用流式蛋白心法深入研究工作较长时间锥体型与厌食症病患者的致病蛋白群无引人注意歧异

8.与较长时间锥体型病患者相比,厌食症病患者腺周碳水化合物第一组织增生提高,尤其是郊外的腺周碳水化合物

在MSK的非转移性ccRCC病患者的前瞻性缓冲区中所,作者合并了20个最显著的丰富的IPA规范路中,这些路中来自于厌食症和较长时间锥体型病患者的PNN和PNA样品的更为(示意图A)。厌食症和较长时间锥体型病患者的PNN和PNA样品中所间的致病伴生(ssGSEA极低分)更为(示意图B)。

示意图S5.与较长时间锥体型的病患者相比,厌食症病患者的膀胱周碳水化合物辨识出增生和栓塞提高

综上,在COMPARZ试制缓冲区中所,经过IMDC安全性极低分修正后,辨认出相对于较长时间锥体型病患者,半胱氨酸丝氨酸衍生物外科手心法提极低了厌食症病患者的成功率,相当多是接受sunitinib外科手心法的病患者。IMDC安全性极低分模型包含的第一组分间接反映宿主因素所对乳癌症系统性增生作用(可有如病变,中所性粒蛋白增多,和白细胞增多症),这些因素所可能也是致病外科手心法结果和BMI中所间相似性机制的状况。辨认出厌食症病患者的静脉转换成得分极低于较长时间锥体型病患者,与之前其他的研究工作得出结论的,参与静脉转换成,β-氟化都能等等DNA的富集的现象一致。因此,静脉转换成的歧异可以部分解释厌食症病患者接受半胱氨酸丝氨酸衍生物外科手心法后的较高预后。

此研究工作为厌食症不确定性提供了生物学支持。在患有ccRCC的病患者观察到厌食症病患者相对于较长时间锥体型的病患者微环境的歧异:相当多是厌食症病患者的的静脉转换成提高,但总锥体增生无引人注意歧异。值得注意的是厌食症病患者的一处碳水化合物辨识提高的增生和栓塞状况。薄膜蛋白乳癌与腺周碳水化合物第一组织微环境的精细强子可能有着病理意义,值得进一步研究工作。

重构注解:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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